Skip to main content

Table 1 Promoter DNA sequences

From: Design and analysis of LacI-repressed promoters and DNA-looping in a cyanobacterium

Promoter name

Sequence 5′ to 3′

BBa_J23100

TTGACGGCTAGCTCAGTCCTAGGTACAGTGCTAGC

BBa_J23101

TTTACAGCTAGCTCAGTCCTAGGTATTATGCTAGC

BBa_J23102

TTGACAGCTAGCTCAGTCCTAGGTACTGTGCTAGC

BBa_J23105

TTTACGGCTAGCTCAGTCCTAGGTACTATGCTAGC

BBa_J23106

TTTACGGCTAGCTCAGTCCTAGGTATAGTGCTAGC

BBa_J23109

TTTACAGCTAGCTCAGTCCTAGGGACTGTGCTAGC

BBa_J23113

CTGATGGCTAGCTCAGTCCTAGGGATTATGCTAGC

BBa_J23114

TTTATGGCTAGCTCAGTCCTAGGTACAATGCTAGC

PnirA

CAAGCTCAGAATGCTGCGGGGAGAAGGGCAACTCCCCACCAGCCCCAAATTTTTGCTGGCGATAAATATTTTTCGGTTTAATTGTTCACAAAGCTTTTTGAATTTGAGTTTATAGAAATTTATTGGCTGGTAATGCTTTTTTGCCCCCCTGCTGGACTTCATTGATCCTTGCCTATACCATCAATATCATTGGTCAATAATGATGATGATTGACTAAAACATGTTTAACAAAATTTAACGCATATGCTAAATGCGTAAACTGCATATGCCTTGGCTGAGTGTAATTTACGTTACAAATTTTAACGAAACGGGAACCCTATATTGATCTCTACTGTTATCTGGCT

PpetE

TCATAGCGGTTGCCCAATCTAACTCAGGGAGCGACTTCAGCCCACAAAAAACACCACTGGGCCTACTGGGCTATTCCCATTATCATCTACATTGAAGGGATAGCAAGCTAATTTTTATGACGGCGATCGCCAAAAACAAAGAAAATTCAGCAATTACCGTGGGTAGCAAAAAATCCCCATCTAAAGTTCAGTAAATATAGCTAGAACAACCAAGCATTTTCGGCAAAGTACTATTCAGATAGAACGAGAAATGAGCTTGTTCTATCCGCCCGGGGCTGAGGCTGTATAATCTACGACGGGCTGTCAAACATTGTGATACCATGGGCAGAAGAAAGGAAAAACGTCCCTGATCGCCTTTTTGGGCACGGAGTAGGGCGTTACCCCGGCCCGTTCAACCACAAGTCCCTATAGATACAATCGCCAAGAAGT

PrnpB

TTCAATGCGGTCCAATACCTCCCCTGCCCAACTGGGTAAGCTCGCGGCTCCACTGAGTAATACAGACAAGGCTAAACAGGCAAATTTTTTCATTGGTCAACTCCTAGCACCAATTTCCCAAGACTACGGAGGGGGCAATGAAGTTTCAATTAATTGGGGTCACAAACCACAGCGGCCTATGGCTCTAATCAATGGCACACTAGAAAAA

Ptrc 2O-(−2)

AATTGTGAGCGCTCACAATTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGCTCACAATTTCACACA

Ptrc 2O-(−1)

AATTGTGAGCGCTCACAATTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGCTCACAATTTCACACA

Ptrc 2O-0

AATTGTGAGCGCTCACAATTTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGCTCACAATTTCACACA

Ptrc 2O-1

AATTGTGAGCGCTCACAATTGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGCTCACAATTTCACACA

Ptrc 2O-2

AATTGTGAGCGCTCACAATTTGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGCTCACAATTTCACACA

Ptrc 2O-3

AATTGTGAGCGCTCACAATTCTGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGCTCACAATTTCACACA

Ptrc 2O-4

AATTGTGAGCGCTCACAATTGCTGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGCTCACAATTTCACACA

Ptrc 2O-5

AATTGTGAGCGCTCACAATTAGCTGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGCTCACAATTTCACACA

Ptrc 2O-6

AATTGTGAGCGCTCACAATTGAGCTGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGCTCACAATTTCACACA

Ptrc 2O-7

AATTGTGAGCGCTCACAATTTGAGCTGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGCTCACAATTTCACACA

Ptrc 2O-8

AATTGTGAGCGCTCACAATTATGAGCTGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGCTCACAATTTCACACA

Ptrc 2O-9

AATTGTGAGCGCTCACAATTAATGAGCTGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGCTCACAATTTCACACA

Ptrc 2O-10

AATTGTGAGCGCTCACAATTAAATGAGCTGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGCTCACAATTTCACACA

Ptrc 2O-11

AATTGTGAGCGCTCACAATTGAAATGAGCTGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGCTCACAATTTCACACA

Ptrc 2O-12

AATTGTGAGCGCTCACAATTTGAAATGAGCTGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGCTCACAATTTCACACA

Ptrc 2O-13

AATTGTGAGCGCTCACAATTCTGAAATGAGCTGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGCTCACAATTTCACACA

Ptrc 2O-14

AATTGTGAGCGCTCACAATTTCTGAAATGAGCTGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGCTCACAATTTCACACA

Ptrc 2O-15

AATTGTGAGCGCTCACAATTTTCTGAAATGAGCTGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGCTCACAATTTCACACA

Ptrc 2O-16

AATTGTGAGCGCTCACAATTATTCTGAAATGAGCTGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGCTCACAATTTCACACA

Ptrc 2O-17

AATTGTGAGCGCTCACAATTTATTCTGAAATGAGCTGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGCTCACAATTTCACACA

Ptrc 2O-18

AATTGTGAGCGCTCACAATTATATTCTGAAATGAGCTGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGCTCACAATTTCACACA

Ptrc 2O-19

AATTGTGAGCGCTCACAATTAATATTCTGAAATGAGCTGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGCTCACAATTTCACACA

Ptrc 2O-20

AATTGTGAGCGCTCACAATTAAATATTCTGAAATGAGCTGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGCTCACAATTTCACACA

Ptrc 2O-21

AATTGTGAGCGCTCACAATTCAAATATTCTGAAATGAGCTGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGCTCACAATTTCACACA

Ptrc 2O-orig

CGAATTGTGAGCGCTCACAATTCGAACGGTTCTGGCAAATATTCTGAAATGAGCTGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACA

Ptrc 1O-dist

AATTGTGAGCGCTCACAATTTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATCACACA

Ptrc 1O-core

AAATATTCTGAAATGAGCTGTTGACAATTGTGAGCGCTCACAATATAATGTGTGGAATCACACA

Ptrc 1O-prox

CGAACGGTTCTGGCAAATATTCTGAAATGAGCTGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGCTCACAATTTCACACA

PA1lacO-1

AAAGAGTGTTGACTTGTGAGCGGATAACAATGATACTTAGATTCAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACA

PtrcOs-prox-8

TTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTAATTGTGAGCGCTCACAATT

PtrcOs-prox-9

TTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGAATTGTGAGCGCTCACAATT

PtrcOs-prox-10

TTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGCTCACAATT

PtrcOs-prox-11

TTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAAATTGTGAGCGCTCACAATT

PtrcOs-prox-12

TTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAGAATTGTGAGCGCTCACAATT

PtrcOs-prox-13

TTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAGTAATTGTGAGCGCTCACAATT

PtrcOs-prox-14

TTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAGTCAATTGTGAGCGCTCACAATT

PtrcOs-prox-15

TTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAGTCGAATTGTGAGCGCTCACAATT

PtrcOs-prox-16

TTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAGTCGTAATTGTGAGCGCTCACAATT

PtrcOs-prox-17

TTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAGTCGTCAATTGTGAGCGCTCACAATT

PtrcOs-prox-18

TTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAGTCGTCCAATTGTGAGCGCTCACAATT

PtrcOs-prox-20

TTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAGTCGTCCAGAATTGTGAGCGCTCACAATT

PtrcOs-prox-22

TTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAGTCGTCCAGACAATTGTGAGCGCTCACAATT

PtrcOs-prox-24

TTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAGTCGTCCAGACTCAATTGTGAGCGCTCACAATT