Skip to main content

Table 2 Primer DNA sequences

From: Design and analysis of LacI-repressed promoters and DNA-looping in a cyanobacterium

Primer name

Sequence 5′ to 3′

VF2 (BBa_G00100)

TGCCACCTGACGTCTAAGAA

VR (BBa_G00101)

ATTACCGCCTTTGAGTGAGC

RBS*-EYFP-BB-f1

CTTTCTAGAGTAGTGGAGGTTACTAGATGGTGAGCAAGGGCG

B0015-BB-r1

GAACTGCAGCGGCCGCTACTAGTATATAAACGCAGAAAGGCCC

j5_00029

GCGGCCGCTGCAGCCCGTAGAAAAGATCAAAGGATCTTCTTGAGA

j5_00030

GCCACGTAGGGGTCTCTAGAAGCGGCCGCGAATTCATGTGAGCAAAAGGCCAGCA

j5_00031

GCCGCTTCTAGAGACCCCTACGTGGCCGGCAATGGTCC

j5_00032

GGTGAAACTGACCGAACATAGGAGACTTTGGTGGGCTGGCCG

j5_00033

CCACCAAAGTCTCCTATGTTCGGTCAGTTTCACCTGATTTACG

j5_00079

CTGGTTTCACATTCACCATGATCAAACCTCCACTACTCTAGTAGCTAGCATTGTACCTAGGACTGAGCTAGCCATAAAGACAGTCATTCATCTTTCTGCCCCTCC

j5_00042

GTAGTGGAGGTTTGATCATGGTGAATGTGAAACCAGTAACGTTATACGATG

j5_00072

GTTCGTTAAGGCTTGATCTCTATTATTACTGCCCGCTTTCCAGTCGG

j5_00073

GGAAAGCGGGCAGTAATAATAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCC

j5_00088

CCCGATCAACTCGTGTCTGCTCCTCGGTTATGTTTTTAAGGTC

j5_00090

CGAGGAGCAGACACGAGTTGATCGGGCACGTAAGAGG

j5_00092

GCCATCCACTTCCTTGGTCTGACAGCTCGAGGCTTGG

j5_00093

GCTGTCAGACCAAGGAAGTGGATGGCCCCGTATTGC

j5_00039

CTTTGATCTTTTCTACGGGCTGCAGCGGCCGCTACTAGTAGGTCCCAAGTTTGTGCTGTGGC

slr0168-UR-f2

AAAGGGGACGAAGCCGCAGTTC

slr0168-DR-r2

ATCGCCGTGGTTAAATCCGTGG

P2OLib-r

TGAGCTACTAGTATGTGTGAAATTGTGAGCGCTCACAATTCCAC

P2OLib-f1O

TCAGAATTCGCGGCCGCTTCTAGAGCGAACGGTTCTGGCAAATATTC

P2OLib-f-2

TCAGAATTCGCGGCCGCTTCTAGAGAATTGTGAGCGCTCACAATTGACAATTAATCATCCGGCTCG

P2OLib-f-1

TCAGAATTCGCGGCCGCTTCTAGAGAATTGTGAGCGCTCACAATTTGACAATTAATCATCCGGCTCG

P2OLib-f0

TCAGAATTCGCGGCCGCTTCTAGAGAATTGTGAGCGCTCACAATTTTGACAATTAATCATCCGGCTC

P2OLib-f1

TCAGAATTCGCGGCCGCTTCTAGAGAATTGTGAGCGCTCACAATTGTTGACAATTAATCATCCGGC

P2OLib-f2

TCAGAATTCGCGGCCGCTTCTAGAGAATTGTGAGCGCTCACAATTTGTTGACAATTAATCATCCGG

P2OLib-f3

TCAGAATTCGCGGCCGCTTCTAGAGAATTGTGAGCGCTCACAATTCTGTTGACAATTAATCATCCGG

P2OLib-f4

TCAGAATTCGCGGCCGCTTCTAGAGAATTGTGAGCGCTCACAATTGCTGTTGACAATTAATCATCCGG

P2OLib-f5

TCAGAATTCGCGGCCGCTTCTAGAGAATTGTGAGCGCTCACAATTAGCTGTTGACAATTAATCATCCG

P2OLib-f6

TCAGAATTCGCGGCCGCTTCTAGAGAATTGTGAGCGCTCACAATTGAGCTGTTGACAATTAATCATCCG

P2OLib-f7

TCAGAATTCGCGGCCGCTTCTAGAGAATTGTGAGCGCTCACAATTTGAGCTGTTGACAATTAATCATCC

P2OLib-f8

TCAGAATTCGCGGCCGCTTCTAGAGAATTGTGAGCGCTCACAATTATGAGCTGTTGACAATTAATCATCC

P2OLib-f9

TCAGAATTCGCGGCCGCTTCTAGAGAATTGTGAGCGCTCACAATTAATGAGCTGTTGACAATTAATCATCC

P2OLib-f10

TCAGAATTCGCGGCCGCTTCTAGAGAATTGTGAGCGCTCACAATTAAATGAGCTGTTGACAATTAATCATC

P2OLib-f11

TCAGAATTCGCGGCCGCTTCTAGAGAATTGTGAGCGCTCACAATTGAAATGAGCTGTTGACAATTAATCATC

P2OLib-f12

TCAGAATTCGCGGCCGCTTCTAGAGAATTGTGAGCGCTCACAATTTGAAATGAGCTGTTGACAATTAATC

P2OLib-f13

TCAGAATTCGCGGCCGCTTCTAGAGAATTGTGAGCGCTCACAATTCTGAAATGAGCTGTTGACAATTAATC

P2OLib-f14

TCAGAATTCGCGGCCGCTTCTAGAGAATTGTGAGCGCTCACAATTTCTGAAATGAGCTGTTGACAATTAATC

P2OLib-f15

TCAGAATTCGCGGCCGCTTCTAGAGAATTGTGAGCGCTCACAATTTTCTGAAATGAGCTGTTGACAATTA

P2OLib-f16

TCAGAATTCGCGGCCGCTTCTAGAGAATTGTGAGCGCTCACAATTATTCTGAAATGAGCTGTTGACAATT

P2OLib-f17

TCAGAATTCGCGGCCGCTTCTAGAGAATTGTGAGCGCTCACAATTTATTCTGAAATGAGCTGTTGACAATT

P2OLib-f18

TCAGAATTCGCGGCCGCTTCTAGAGAATTGTGAGCGCTCACAATTATATTCTGAAATGAGCTGTTGACAATT

P2OLib-f19

TCAGAATTCGCGGCCGCTTCTAGAGAATTGTGAGCGCTCACAATTAATATTCTGAAATGAGCTGTTGACAA

P2OLib-f20

TCAGAATTCGCGGCCGCTTCTAGAGAATTGTGAGCGCTCACAATTAAATATTCTGAAATGAGCTGTTGACA

P2OLib-f21

TCAGAATTCGCGGCCGCTTCTAGAGAATTGTGAGCGCTCACAATTCAAATATTCTGAAATGAGCTGTTGAC

P1Od-f1

AAGTCTAGAGAATTGTGAGCGCTCACAATTTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATCACACATACTAGAGTAGTGGAGGTTACTAGATGG

P1Oc-f1

AAGTCTAGAGAAATATTCTGAAATGAGCTGTTGACAATTGTGAGCGCTCACAATATAATGTGTGGAATCACACATACTAGAGTAGTGGAGGTTACTAGATGG

PA1lacO1-FP-f1

AAGTCTAGAGAAAGAGTGTTGACTTGTGAGCGGATAACAATGATACTTAGATTCAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACATACTAGAGTAGTGGAGGTTACTAGATGG

PtrcOs-prox-8-f1

TTCTCTAGAGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTAATTGTGAGCGCTCACAATTTACTAGAGTAGTGGAGGTTACTAGATGG

PtrcOs-prox-9-f1

TTCTCTAGAGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGAATTGTGAGCGCTCACAATTTACTAGAGTAGTGGAGGTTACTAGATGG

PtrcOs-prox-10-f1

TTCTCTAGAGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGCTCACAATTTACTAGAGTAGTGGAGGTTACTAGATGG

PtrcOs-prox-11-f1

TTCTCTAGAGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAAATTGTGAGCGCTCACAATTTACTAGAGTAGTGGAGGTTACTAGATGG

PtrcOs-prox-12-f1

TTCTCTAGAGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAGAATTGTGAGCGCTCACAATTTACTAGAGTAGTGGAGGTTACTAGATGG

PtrcOs-prox-13-f1

TTCTCTAGAGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAGTAATTGTGAGCGCTCACAATTTACTAGAGTAGTGGAGGTTACTAGATGG

PtrcOs-prox-14-f1

TTCTCTAGAGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAGTCAATTGTGAGCGCTCACAATTTACTAGAGTAGTGGAGGTTACTAGATGG

PtrcOs-prox-15-f1

TTCTCTAGAGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAGTCGAATTGTGAGCGCTCACAATTTACTAGAGTAGTGGAGGTTACTAGATGG

PtrcOs-prox-16-f1

TTCTCTAGAGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAGTCGTAATTGTGAGCGCTCACAATTTACTAGAGTAGTGGAGGTTACTAGATGG

PtrcOs-prox-17-f1

TTCTCTAGAGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAGTCGTCAATTGTGAGCGCTCACAATTTACTAGAGTAGTGGAGGTTACTAGATGG

PtrcOs-prox-18-f1

TTCTCTAGAGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAGTCGTCCAATTGTGAGCGCTCACAATTTACTAGAGTAGTGGAGGTTACTAGATGG

PtrcOs-prox-20-f1

TTCTCTAGAGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAGTCGTCCAGAATTGTGAGCGCTCACAATTTACTAGAGTAGTGGAGGTTACTAGATGG

PtrcOs-prox-22-f1

TTCTCTAGAGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAGTCGTCCAGACAATTGTGAGCGCTCACAATTTACTAGAGTAGTGGAGGTTACTAGATGG

PtrcOs-prox-24-f1

TTCTCTAGAGTTGACAATTAATCATCCGGCTCGTATAATGTGTGGAGTCGTCCAGACTCAATTGTGAGCGCTCACAATTTACTAGAGTAGTGGAGGTTACTAGATGG